野鸭湖湿地的鸟类总数达303种，隶属于18目61科，占全市鸟类总种数（448种，18目，59科）的67.41%，其中大鸨、金雕、黑鹳等10种为国家Ⅰ级保护动物，大天鹅、灰鹤等43种为国家Ⅱ级保护动物。

留鸟：以雀鸦类为主，另有金雕、凤头白灵、大斑啄木鸟、环劲雉等。夏候鸟：苍鹭、池鹭、白鹭、绿头鸭、白骨顶、凤头麦鸡、东方大苇莺等。冬候鸟：大鸨、豆雁、灰鹤等。旅鸟：白头鹤、白鹤、白尾海雕、大天鹅、小天鹅、鸿雁、红隼等。

野鸭湖共有高等植物472种，隶属95科285属，其中苔藓植物16种，隶属9科9属；蕨类8种，隶属5科5属；种子植物448种，隶属81科271属。