野鸭湖湿地自然保护区（简称野鸭湖）是延庆县政府1997年7月批准成立的县级自然保护区；2000年晋升为市级自然保护区，2002年8月，县政府报请市政府编制委员会批准成立管理机构为北京延庆野鸭湖湿地自然保护区管理处，县政府直属正处级二级班子单位。

2007年，延庆县委县政府将“北京野鸭湖国家湿地公园”试点建设工作列入重点工作，成立了由主管副县长为组长的领导工作小组。2011年3月成立了野鸭湖国家湿地公园管理处（县处级），配备了一正三副领导班子，下设四科一室一中心。

北京延庆野鸭湖湿地自然保护区和北京野鸭湖国家湿地公园用的是同一套领导班子。